至明中叶，中日医学交流进一步走向成熟。日僧月湖于景泰三年（1452年）来到中国，从学于明代医学家虞抟，并以医为业，著有《全九集》（1453年）、《济阴方》（1455年）等著作。成化二十三年（1487年），日人田代三喜来华学习中医药学。他崇尚李杲、朱丹溪学说，弘治七年（1494年）返日后大力倡导李、朱学说，著有《捷术大成印可集》、《福药势剪》、《直指篇》、《医案口诀》等书，推动李杲、朱丹溪学说在日本医学界的传播。后来以他为首在日本逐渐形成一个学派。弘治五年（1492年），日人坂净运来到中国，留居八年，学习中医与张仲景学说。回日本时，他带去了《伤寒杂病论》等著作，并先后撰写《新椅方》、《续添鸿宝秘要钞》等书，向日本医界介绍传播张仲景学说。嘉靖十八年至二十六年（1539—1547年），吉田宗桂两次来华。第二次在华期间，他曾治愈过明世宗的疾病，回日本时明世宗赠以颜辉《扁鹊图》与《圣济总录》等中医药著作。吉田宗桂医术高超，尤精于本草学，被誉为“日本日华子”。